1996年，管理科学与工程学科获批建设；2008年，被批准为北京市重点建设学科；2016年，在教育部第四轮学科水平评估中获评C+。2018年，本学科与首都经济贸易大学联合培养博士研究生；2019年，与北京交通大学开展学科共建，成为北京市高精尖建设学科。管理科学与工程学科是公司院建设高水平特色型大学的重要支撑，重视以物流与供应链领域为特色研究方向、以国家物流与供应链相关政策为导向，坚持基础理论研究和应用研究并重，创新物流与供应链管理工程领域的关键方法和核心技术，成为国内物流与供应链相关领域的重要研究平台。

管理科学与工程学科现设有四个研究方向，分别为物流与供应链管理、采购理论与方法、优化理论与方法、信息技术与管理。

1.物流与供应链管理方向

主要研究企业物流系统优化设计、城市配送、供应链战略、物流网络、资源配置优化等问题，建立本土化的物流与供应链理论体系，为企业、城市、国家与区域的物流系统规划、物流网络优化、物流资源整合、物流系统运营优化提供设计方案。重点研究领域为：物流与供应链系统理论研究、企业物流系统、城市物流。

2.采购理论与方法方向

主要研究政府采购、大宗商品采购理论与方法，建立本土化的采购理论体系。重点研究领域为：采购管理理论与运作系统优化研究、采购商品质量控制方法研究。

3.优化理论与方法方向

主要研究大数据环境下复杂系统设计与运营相关的建模与优化分析、复杂博弈问题。重点研究领域为：大规模复杂系统优化设计与运营管理研究、数据挖掘与应用研究。

4.信息技术与管理方向

主要面向现代管理与服务需求，研究复杂系统的组织与运营的智慧化、数字化、网络化、自动化技术与方法及最佳实践。重点研究领域为：智慧物流系统的组织与协同研究、商务智能研究。